Согласно жалобам сотрудников, есть множество недостатков, которые мешают их повседневной работе, а также проблемы с ремонтом и обслуживанием оборудования и систем кондиционирования и отопления, что приводит к тому, что они называют хаосом в EFKA.
Также возникают проблемы с комплектованием различных сотрудников фонда, поскольку число людей, работающих в EFKA и его предыдущих фондах в Аттике, сократилось на треть с 2011 года из-за выхода на пенсию или увольнения. Сотрудники организации показывают, что руководство фонда также приняло практику назначения на должности начальников отделов лиц, которые переводятся из других государственных организаций и не знакомы с законодательной базой социального обеспечения.
По мнению представителей правительства, такая ротация позволяет избежать коррупции и казнокрадства, но не способствует стабильной работе фонда.
Однако, пожалуй, самая большая проблема работы фонда заключается в неспособности полностью объединить и согласовать ИТ-системы старых служб социального обеспечения, которые были включены в EFKA после реформы, что приводит к возникновению огромных сложностей для сотрудников, пенсионеров и обычных граждан, имеющих медицинскую страховку.