Первоначально возведение нового музейного здания было приурочено к открытию Олимпийских игр 2004 г. Греческие власти рассчитывали на то, что им удастся вернуть в коллекцию Акрополя статуи и фризы Парфенона, вывезенные в Лондон еще в начале XIX в. и в настоящее время выставленные в Британском музее. Однако британская сторона отказалась передать экспонаты, и открытие «второго Акрополя» пришлось отложить. Позднее строительные работы были возобновлены и, согласно последним заявлениям официальных лиц, должны завершиться к концу этого года.
В экспозиции музея Акрополя представлены уникальные произведения античной скульптуры, фрагменты фриза и рельефов культовых храмов Парфенона и Эрехтейона, кариатиды и другие образцы архаического и классического искусства, обладающие исключительной художественной ценностью.