Обошедшийся в 130 миллионов евро музей построен по проекту швейцарского архитектора Бернарда Шуми. По первоначальному замыслу, новое здание должно было принять гостей еще в 2004 году, когда в Афинах проходили Олимпийские игры. Однако открытие музея последовательно отодвигалось - на конец 2007-го, потом на сентябрь и декабрь 2008-го.
Сейчас же для посетителей открыт первый этаж, где проводятся временные выставки. Основная экспозиция размещается на верхних этажах.
Старый, уже много лет закрытый музей находится на самом Акрополе, а новый расположен у его подножия, недалеко от станции метро. В новом здании будут экспонироваться не только скульптуры из храмов Акрополя и находки, сделанные на холме, но и копии вывезенных из Греции античных произведений искусства, связанных с Акрополем.