У Хаменеи пять сыновей и две дочери. Его второй сын Моджтаба Хаменеи считается вероятным преемником.
Родившийся в 1969 году, Моджтаба Хаменеи имеет глубокие связи с КСИР (Корпус стражей исламской революции) и религиозным истеблишментом Кума. Он служил в вооружённых силах страны во время финальной фазы войны Иран-Ирак, и, хотя он занимает средний духовный сан (не аятолла), его статус усиливается через поддержку религиозного истеблишмента Кума, где он поддерживает тесные отношения с влиятельными шиитскими клириками.
Его назначение может вызвать протесты, особенно среди реформаторов и молодёжи, недовольных династическим подходом. Также есть риск раскола внутри элиты, если КСИР не сможет консолидировать поддержку.
Моджтаба считается сторонником жёсткой линии, продолжая антизападную и антиизраильскую политику отца. Он поддерживает экспансию влияния Ирана через прокси-группы, такие как "Хезболла" и "ХАМАС", и, вероятно, будет усиливать ядерную программу.
На 19 июня 2025 года состояние здоровья Али Хаменеи (86 лет) остаётся предметом обсуждений, что усиливает внимание к Моджтабе. Недавние эскалации с Израилем и США подчёркивают важность преемственности, и Моджтаба активно готовится к этой роли, усиливая свои позиции в КСИР.
Среди других кандидатов упоминается Алиреза Арафи, обладающий сильными позициями в иранской структуре власти. Надёжный соратник Хаменеи, Арафи занимает ключевые посты, включая должность вице-президента Собрания экспертов, является членом Совета стражей и главой пятничных молитв — священного дня мусульман — в священном для шиитов городе Кум.
Другой возможный преемник — Али Асгар Хезази, глава отдела политической безопасности офиса Верховного лидера Ирана. Известный своей закулисной властью, Хезази уже давно участвует в разведывательном аппарате режима и играет важную роль в принятии стратегических решений.
Также среди потенциальных преемников называют Голама Хосейна Мохсени Эджеи, бывшего министра информации при Махмуде Ахмадинежаде, Мохаммада Голпайегани, десятилетиями возглавляющего офис Хаменеи, бывших министров иностранных дел Али Акбара Велаяти и Камаля Харази, а также бывшего спикера парламента Али Лариджани.